FC吞食天地2诸神传作为经典RPG的特别版本，在难度设计上提供了多种选择以适应不同玩家的需求。游戏初始界面会提示玩家选择难度等级，通常分为初级、中级和高级三个档位。初级难度适合初次接触该改版或希望体验剧情的玩家，敌方兵力与属性较低，计策成功率较高，资源获取相对容易。中级难度需要玩家对原版游戏机制有一定了解，敌方数值平衡且会使用更多计策组合。高级难度则考验玩家的策略规划能力，敌方兵力与属性显著提升，部分战斗甚至需要特定阵容或道具才能通过。
诸神传的难度差异主要体现在战斗系统与资源管理两方面。初级难度下战斗节奏较慢，玩家有充足时间调整战术，而高级难度中敌方行动频率更高且会优先攻击薄弱环节。资源方面，初级难度可通过常规探索获得足够装备与补给，高级难度则需精打细算每一份资源，部分关键道具如龙魂玉玺的获取条件更为苛刻。不同难度下隐藏关卡的开启条件也有所区别，高级难度往往需要完成额外支线任务或达到特定等级才能触发。
武将培养在不同难度下的策略差异显著。初级难度允许玩家自由搭配阵容，即使非主力武将也能发挥作用；高级难度则需重点培养核心武将如赵云、马超等，并合理分配进阶石等稀有资源。军师的选择也更为关键，高级难度下高智力军师能显著提升计策成功率与解阵效率。部分特殊武将如日巫女和马云禄的招募条件在不同难度下存在微妙差别，需根据当前难度调整获取流程。
通关路线规划是应对高难度的核心策略。初级难度可线性推进主线剧情，高级难度则建议优先完成能提升队伍实力的支线任务，如早期获取赤兔马或隐藏装备。战斗前需充分侦查敌方阵型，针对性地调整己方阵型与装备。八卦阵在高难度战斗中尤为重要，需熟练掌握生门死门的设定规则。部分特殊战斗如对抗司马懿时，需预留招魂丹等道具应对突发状况。
隐藏要素的探索价值随难度提升而增加。高级难度下隐藏道具如星辰粉末、神铁等对队伍强度影响更大，需通过复制技巧合理分配使用。部分稀有装备如雷剑、钢甲系列需要通过特定路径调查场景获取，这些装备的属性加成在高难度战斗中尤为关键。游戏后期隐藏武将的加入条件也与难度挂钩，需提前规划招募顺序。
诸神传通过多层级难度设计丰富了游戏的可重玩性。玩家可根据自身实力选择合适难度，逐步挑战更高阶内容。无论选择何种难度，充分理解游戏机制、合理分配资源以及灵活调整战术都是通关的关键要素。该改版在保留原版核心玩法的基础上，通过难度梯度设计为玩家提供了更具深度的策略体验。
